GWHABKL00000001

基因组信息

病毒株名 WIV04
序列号 GWHABKL00000001
宿主 Homo sapiens
数据来源 Genome Warehouse
采样日期 2019-12-30
采样地点 China / Hubei / Wuhan
相关ID EPI_ISL_402124,MN996528.1
谱系 B (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/0/0/NO
样本提供单位 CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
数据递交单位 CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety and Center for Emerging Infectious Diseases, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences
发布时间 2020-01-30 15:38:41

临床信息

年龄 49
性别 F
职业 Fresh seafood market peddlers or deliverymen
发作日期 2019-12-23
入院日期 2019-12-27
旅行史/接触史 A frequent visitor to the seafood wholesale market
严重程度 Serious
病患状态 Fever, malaise and cough (2020/1/13)
临床症状及潜伏天数 Fever (37.9 ℃) and palpitation
临床检测 Blood IgM tests,legionella pneumophilia, mycoplasma pneumoniae, chlamydia pneumoniae, respiratory syncytial virus, adenovirus, rickettsia, influenza A virus, influenza B virus, parainfluenza virus
基础病史 NA
其他病原菌感染 NA
合并症 NA
临床用药和处理 NA
生理生化指标追踪 BALF, oral swab, blood(Ab), anal swab, blood(PCR)
出院日期 NA
相关文献 A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. [PMID: 32015507]

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 WIV04 (GWHABKL00000001)
SNP数目 0
Insertion数目 0
Deletion数目 1
Indel数目 0
相似度 100.00
质量评估分级 A
注释统计 1(intergenic_variant:1)
文件下载 (GFF3)