EPI_ISL_416473

基因组信息

病毒株名 hCoV-19/Hangzhou/ZJU-08/2020
序列号 EPI_ISL_416473
宿主 Homo sapiens
数据来源 GISAID
采样日期 2020-01-26
采样地点 China / Zhejiang / Hangzhou
相关ID
谱系 A (Version: 4.0.6)
序列完整度 Complete
质量评估 0/0/3/13/Yes
样本提供单位 State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China 310003
数据递交单位 State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China 310003
发布时间 2020-03-23 07:08:31

临床信息

年龄 53
性别 M
职业 NA
发作日期
入院日期
旅行史/接触史 Live in Wuhan
严重程度 Critical
病患状态 Recover
临床症状及潜伏天数 Fever,fatigue
临床检测 Ultra-deep sequencing of the isolated viral genomic RNA(Illumina Novaseq 6000 platform)
基础病史 NA
其他病原菌感染 NA
合并症 NA
临床用药和处理 NA
生理生化指标追踪 NA
出院日期 2020.02.19

基因组变异统计

参考序列 2019-nCoV (MN908947.3)
病毒株名 hCoV-19/Hangzhou/ZJU-08/2020 (EPI_ISL_416473)
SNP数目 10
Insertion数目 2
Deletion数目 1
Indel数目 1
相似度 99.95
质量评估分级 B2
注释统计 14(synonymous_variant:2; intergenic_variant:11; missense_variant:1)
文件下载 (GFF3)
The variation information in this file was calculated based on sequence EPI_ISL_416473.The original sequence can be obtained from GISAID's website.