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2019新型冠状病毒信息库
国家生物信息中心
2019新型冠状病毒信息库 (2019nCoVR)
Version 2.2
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变异时空变化
变异时空变化
频率
默认
0.0005
0.01
0.1
0.5
按方差排序
默认
升序
降序
基因/区域名称
全部
5'UTR
orf1ab
Intergenic
S
ORF3a
E
M
ORF6
ORF7a
ORF8
N
ORF10
3'UTR
变异类型
全部
intergenic_variant
upstream_gene_variant
start_lost
coding_sequence_variant
missense_variant
synonymous_variant
inframe_deletion
frameshift_variant
stop_gained
protein_altering_variant
inframe_insertion
stop_retained_variant
stop_lost
downstream_gene_variant
转录调控及酶切位点
全部
TRS:orf1ab
TRS:S
TRS:ORF3a
TRS:E
TRS:M
TRS:ORF6
TRS:ORF7a
TRS:ORF8
TRS:N
TRS:ORF10
Furin:S
变异时间变化
变异地域变化(世界)
变异地域变化(中国)
通过计算截止各时间点变异位点的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点随时间发展的变化趋势(默认显示频率大于0.05的位点,用户可根据需要自行选择不同频率的位点)。如:ORF1ab基因的11083位点,随着疫情发展其群体发生频率从0逐步增加到22%,随后递减至8%。
通过计算各国家的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点在各地区的变化趋势(默认显示频率大于0.05的位点,用户可根据需要自行选择不同频率的位点)。
通过计算中国各省市的群体发生频率,用热度图形式动态展示了变异位点在各地区的变化趋势(默认显示频率大于0.05的位点,用户可根据需要自行选择不同频率的位点)。