国家生物信息中心
2019新型冠状病毒信息库

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2019新型冠状病毒信息库 (2019nCoVR)

变异鉴定

目前仅支持2019-nCoV作为reference的在线变异鉴定。输入文件必须是fasta格式的病毒全基因组序列,不支持片段序列分析。参数说明:
1)NC - 输入fasta序列中允许的N碱基的最大值,默认值是15;
2)SC - 输入fasta序列中允许的简并碱基的最大值,默认值是50。

上传文件
NC
SC
运行
输入文件格式
>BetaCoV/Wuhan/IVDC-HB-01/2019 EPI_ISL_402119 ATTAAAGGTTTATACCTTCCCAGGTAACAAACCAACCAACTTTCGATCTCTTGTAGA TCTGTTCTCTAAACGAACTTTAAAATCTGTGTGGCTGTCACTCGGCTGCATGCTTAG TGCACTCACGCAGTATAATTAATAACTAATTACTGTCGTTGACAGGACACGAGTAAC TCGTCTATCTTCTGCAGGCTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTGCAGCCGATCATCAGC ACATCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTCCCTGG TTTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTTTACAGGTTCGCGACGT GCTCGTACGTGGCTTTGGAGACTCCGTGGAGGAGGTCTTATCAGAGGCACGTCAGCT TAACGGAGGGGCATACACTCGCTATGTCGATAACAACTTCTGTGGCCCTGATGGCTA