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2019新型冠状病毒信息库

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2019新型冠状病毒信息库 (2019nCoVR)

S蛋白突变位点分析与结构展示

Spike蛋白结构(PDB_ID: 6VSB)

Spike为三聚体,如下图所示ABC三条相同链组成,分别为用蓝色,黄色,绿色显示。 此外,Spike蛋白与其受体人ACE2结合片段为residues: 336-516,3条链均有此片段,统一用青色显示。

SARS_COV_2的Spike序列突变分析

突变名称 病毒株数 在ACE2结合区域 是否关键互作氨基酸 基因组位置 查看结构图
2F>V/YX/L 16 NO NO 21566
2F>Y 3 NO NO 21567
2F>L 34 NO NO 21568
3V>I/VX/VF/F 45 NO NO 21569
3V>G 326 NO NO 21570
4F>L 4 NO NO 21572
4F>S 5 NO NO 21573
5L>I/F/V 7816 NO NO 21575
6V>I/F/L 221 NO NO 21578
6V>A/G/D 204 NO NO 21579
7L>V 6 NO NO 21581
7L>S 10 NO NO 21582
7L>F 342 NO NO 21583
8L>V 19 NO NO 21584
8L>W/S 10 NO NO 21585
8L>F 64 NO NO 21586
9P>S/T 101 NO NO 21587
9P>R/L/Q 130 NO NO 21588
10L>I/X 158 NO NO 21590
10L>Q/R 4 NO NO 21591
11V>I/L/F 52 NO NO 21593
11V>A 8 NO NO 21594
12S>P 13 NO NO 21596
12S>F/C/Y 1032 NO NO 21597
13S>C/G 4 NO NO 21599
13S>T/I/N 2442 NO NO 21600
14Q>E/K 9 NO NO 21602
14Q>L/R 26 NO NO 21603
14Q>H 157 NO NO 21604
15C>R 5 NO NO 21605
15C>F/X/S 46 NO NO 21606
16V>I/ATLRI/F 73 NO NO 21608
16V>A/G 8 NO NO 21609
17N>D/Y 5 NO NO 21611
17N>S/T/I 14 NO NO 21612
17N>K 20 NO NO 21613
18L>I/F 39118 NO NO 21614
18L>R 3 NO NO 21615
19T>S/A 9 NO NO 21617
19T>R/K/I 265 NO NO 21618
20T>P/A/S/TRTQLPPAYTNSFTRGVYS 17 NO NO 21620
20T>N/S/I 921 NO NO 21621
21R>G 31 NO NO 21623
21R>K/I/T 1331 NO NO 21624
21R>S 103 NO NO 21625
22T>S/P/A 23 NO NO 21626
22T>N/I 547 NO NO 21627
23Q>K 15 NO NO 21629
23Q>R/L 51 NO NO 21630
23Q>H 637 NO NO 21631
24L>V/I 15 NO NO 21632
24L>S 32 NO NO 21633
24L>F/LX 9 NO NO 21634
25P>T/S 362 NO NO 21635
25P>L/H 122 NO NO 21636
26P>T/S 1267 NO NO 21638
26P>L/H/R 526 NO NO 21639
27A>T/S/P 403 NO NO 21641
27A>V/E 205 NO NO 21642
28Y>N/H 165 NO NO 21644
28Y>F/C 4 NO NO 21645
29T>A/S 15 NO NO 21647
29T>I/S 579 NO NO 21648
30N>Y/H 36 NO NO 21650
30N>I/S/T 38 NO NO 21651
30N>K 22 NO NO 21652
31S>F 17 NO NO 21654
32F>L/I 54 NO NO 21656
32F>S/Y 6 NO NO 21657
32F>L 479 NO NO 21658
33T>S/A 7 NO NO 21659
33T>R/K/I 170 NO NO 21660
34R>C 2 NO NO 21662
34R>L 13 NO NO 21663
35G>V 54 NO NO 21666
36V>I/F/L 41 NO NO 21668
36V>A 3 NO NO 21669
38Y>C 1 NO NO 21675
39P>S/T 4 NO NO 21677
39P>L 2 NO NO 21678
40D>N 1 NO NO 21680
41K>E 3 NO NO 21683
41K>I/R 5 NO NO 21684
41K>N 3 NO NO 21685
42V>I/F 9 NO NO 21686
45S>P 4 NO NO 21695
45S>Y/F 6 NO NO 21696
46S>A/P 18 NO NO 21698
46S>L/* 23 NO NO 21699
47V>F/I 53 NO NO 21701
47V>D/A 4 NO NO 21702
48L>S 1 NO NO 21705
49H>Y/N 1073 NO NO 21707
49H>L 1 NO NO 21708
50S>T/P/A 12 NO NO 21710
50S>L 62 NO NO 21711
51T>A 2 NO NO 21713
51T>I 313 NO NO 21714
52Q>K/E 19 NO NO 21716
52Q>R/L 175 NO NO 21717
52Q>H 114 NO NO 21718
53D>N 6 NO NO 21719
53D>G 5 NO NO 21720
54L>S 1 NO NO 21723
54L>F 1564 NO NO 21724
55F>L 3 NO NO 21725
55F>Y 3 NO NO 21726
57P>S 6 NO NO 21731
57P>L/PX 5 NO NO 21732
59F>L 3 NO NO 21737
59F>Y/S 119 NO NO 21738
61N>D 1 NO NO 21743
61N>S 2 NO NO 21744
61N>K 19 NO NO 21745
62V>I/F/L 65 NO NO 21746
62V>D 2 NO NO 21747
63T>S/A/P 7 NO NO 21749
63T>N/I 17 NO NO 21750
64W>R/G 63 NO NO 21752
64W>*/L 31 NO NO 21753
64W>C 63 NO NO 21754
65F>L 6 NO NO 21755
65F>S 4 NO NO 21756
65F>L 205 NO NO 21757
66H>Y/N 3 NO NO 21758
66H>P/R/L 23 NO NO 21759
66H>Q 142 NO NO 21760
67A>T/S/GS 312 NO NO 21761
67A>D/V 652 NO NO 21762
68I>L/X 89330 NO NO 21764
68I>K/R/T/X 51 NO NO 21765
68I>M 41 NO NO 21766
69H>D/N/Y 218 NO NO 21767
69H>L/P/R 31 NO NO 21768
69H>Q 48 NO NO 21769
70V>F/L/I/VI 193 NO NO 21770
70V>A 20 NO NO 21771
71S>P/T 96 NO NO 21773
71S>Y/F 167 NO NO 21774
72G>R/W 269 NO NO 21776
72G>V/E 121 NO NO 21777
73T>A 6 NO NO 21779
73T>I/N 42 NO NO 21780
74N>Y/D 10 NO NO 21782
74N>S/T 4 NO NO 21783
74N>K 30 NO NO 21784
75G>S/R/C 552 NO NO 21785
75G>A/D/V 361 NO NO 21786
76T>A 11 NO NO 21788
76T>N/I/S 394 NO NO 21789
77K>M/R 38 NO NO 21792
77K>N 71 NO NO 21793
78R>G 14 NO NO 21794
78R>K/M 80 NO NO 21795
78R>S 76 NO NO 21796
79F>I/V/L 18 NO NO 21797
79F>S 1 NO NO 21798
79F>L 11 NO NO 21799
80D>N/H/Y 1457 NO NO 21800
80D>V/G/A 552 NO NO 21801
80D>E 147 NO NO 21802
81N>Y 3 NO NO 21803
82P>S 4 NO NO 21806
82P>H/L 36 NO NO 21807
83V>F/L/I 103 NO NO 21809
83V>A 4 NO NO 21810
84L>I/V 309 NO NO 21812
85P>S/T 12 NO NO 21815
85P>L 7 NO NO 21816
86F>Y/S 5 NO NO 21819
87N>Y/D 3 NO NO 21821
87N>S 3 NO NO 21822
87N>K 111 NO NO 21823
88D>N/H/Y 105 NO NO 21824
88D>V/G/A 5 NO NO 21825
88D>E 21 NO NO 21826
90V>I/F/L 247 NO NO 21830
92F>L/I 2 NO NO 21836
93A>S 23 NO NO 21839
93A>G/V 2 NO NO 21840
94S>T/P/A 17 NO NO 21842
94S>F/C 75 NO NO 21843
95T>A 18 NO NO 21845
95T>N/S/I 1586 NO NO 21846
96E>K/Q 51 NO NO 21848
96E>G/A 70 NO NO 21849
96E>D 336 NO NO 21850
97K>E/Q 16 NO NO 21851
97K>M/T/R 18 NO NO 21852
97K>N 89 NO NO 21853
98S>P 22 NO NO 21854
98S>Y/F/C 7922 NO NO 21855
99N>D 30 NO NO 21857
99N>S 5 NO NO 21858
99N>K 363 NO NO 21859
100I>V/L 39 NO NO 21860
100I>T 18 NO NO 21861
100I>M 2 NO NO 21862
101I>L/V 11 NO NO 21863
101I>T 10 NO NO 21864
101I>M 5 NO NO 21865
102R>G 29 NO NO 21866
102R>T/K/I 243 NO NO 21867
102R>S 143 NO NO 21868
103G>C 1 NO NO 21869
103G>A 2 NO NO 21870
104W>L 9 NO NO 21873
104W>C 8 NO NO 21874
105I>L/V 28 NO NO 21875
105I>T 1 NO NO 21876
105I>M 4 NO NO 21877
107G>C 7 NO NO 21881
108T>I 6 NO NO 21885
109T>A 9 NO NO 21887
109T>S 3 NO NO 21888
110L>F 63 NO NO 21892
111D>N 162 NO NO 21893
112S>P 13 NO NO 21896
112S>L 52 NO NO 21897
113K>E 1 NO NO 21899
113K>R 2 NO NO 21900
113K>N 93 NO NO 21901
114T>S/A 2 NO NO 21902
115Q>H 17 NO NO 21907
116S>C 2 NO NO 21909
117L>I 98 NO NO 21911
118L>I/F 103 NO NO 21914
119I>V 62 NO NO 21917
120V>F/I 27 NO NO 21920
120V>A 1 NO NO 21921
121N>D 12 NO NO 21923
121N>I/T 4 NO NO 21924
122N>S 2 NO NO 21927
122N>K 153 NO NO 21928
123A>S/T 7 NO NO 21929
123A>V 12 NO NO 21930
124T>A 1 NO NO 21932
124T>I/S/N 14 NO NO 21933
125N>H 1 NO NO 21935
125N>S 24 NO NO 21936
126V>F/I 13 NO NO 21938
126V>G/A 4 NO NO 21939
127V>F/I 83 NO NO 21941
127V>A 12 NO NO 21942
128I>F/V 19 NO NO 21944
129K>R 1 NO NO 21948
129K>N 22 NO NO 21949
130V>F/L 16 NO NO 21950
130V>A/G 3 NO NO 21951
132E>K/Q 49 NO NO 21956
132E>A 18 NO NO 21957
132E>D 8 NO NO 21958
134Q>E 1 NO NO 21962
134Q>L/R 6 NO NO 21963
134Q>H 14 NO NO 21964
135F>L/I 9 NO NO 21965
136C>G/R 7 NO NO 21968
136C>Y 4 NO NO 21969
137N>Y/D 7 NO NO 21971
137N>S 22 NO NO 21972
137N>K 65 NO NO 21973
138D>H/Y/N 1994 NO NO 21974
138D>A/G 22 NO NO 21975
139P>S 7 NO NO 21977
139P>L 9 NO NO 21978
140F>L/V 69 NO NO 21980
140F>S 84 NO NO 21981
140F>L 35 NO NO 21982
141L>V 56 NO NO 21983
141L>F 129 NO NO 21985
142G>S/C 364 NO NO 21986
142G>A/D/X/V 159 NO NO 21987
143V>X/F/I/L 1488 NO NO 21989
143V>VX/D/G 82047 NO NO 21990
144Y>H/X 32 NO NO 21992
144Y>F/C/S 43 NO NO 21993
145Y>D/N/H 60 NO NO 21995
146H>N/Y 526 NO NO 21998
146H>L/R 21 NO NO 21999
146H>Q 978 NO NO 22000
147K>E/Q 9 NO NO 22001
147K>T/I/R 9 NO NO 22002
147K>N/KN 21 NO NO 22003
148N>H/Y/D 22 NO NO 22004
148N>S/T 42 NO NO 22005
148N>K 162 NO NO 22006
149N>Y/H/D 27 NO NO 22007
149N>S/T 3 NO NO 22008
150K>E/Q 3 NO NO 22010
150K>I/R 25 NO NO 22011
150K>N 24 NO NO 22012
151S>G/R 50 NO NO 22013
151S>I/N/T 155 NO NO 22014
151S>R 4 NO NO 22015
152W>R/G 197 NO NO 22016
152W>L 233 NO NO 22017
152W>C 2284 NO NO 22018
153M>L/V 54 NO NO 22019
153M>K/T 3268 NO NO 22020
153M>I 583 NO NO 22021
154E>K/Q 61 NO NO 22022
154E>V/G/A 24 NO NO 22023
154E>D 10 NO NO 22024
155S>G/R 29 NO NO 22025
155S>N/T/I 69 NO NO 22026
155S>R 13 NO NO 22027
156E>Q/K 40 NO NO 22028
156E>V/G/A 79 NO NO 22029
156E>D 92 NO NO 22030
157F>L 13 NO NO 22031
157F>Y/S 151 NO NO 22032
157F>L 587 NO NO 22033
158R>G 19 NO NO 22034
158R>I/K 12 NO NO 22035
158R>S 12 NO NO 22036
159V>I/F 20 NO NO 22037
159V>A 3 NO NO 22038
160Y>LD/N/H 8 NO NO 22040
161S>T/A 4 NO NO 22043
161S>Y 1 NO NO 22044
162S>G 1 NO NO 22046
162S>N/I 34 NO NO 22047
162S>R 7 NO NO 22048
163A>T/S 10 NO NO 22049
163A>E/V/G 28 NO NO 22050
164N>D/H 5 NO NO 22052
164N>T/I/S 471 NO NO 22053
165N>H 3 NO NO 22055
167T>S 3 NO NO 22061
167T>I/S 7 NO NO 22062
168F>L 2 NO NO 22064
168F>L 3 NO NO 22066
169E>K 6 NO NO 22067
169E>D 13 NO NO 22069
170Y>D/H 12 NO NO 22070
171V>L/F/I 45 NO NO 22073
171V>D/G/A 12 NO NO 22074
172S>A 5 NO NO 22076
172S>F/Y 6 NO NO 22077
173Q>K/E 325 NO NO 22079
173Q>P/R/L 13 NO NO 22080
173Q>H 45 NO NO 22081
174P>T/S 55 NO NO 22082
174P>PF/L/H/R 12 NO NO 22083
175F>I/L/V 6 NO NO 22085
175F>FLMDLEGKQGNFKN/S/C 22 NO NO 22086
175F>L 4 NO NO 22087
176L>I/F 1168 NO NO 22088
176L>R/H/P 3 NO NO 22089
177M>V 10 NO NO 22091
177M>K/T 38 NO NO 22092
177M>I 243 NO NO 22093
178D>N/Y/H 143 NO NO 22094
178D>G 119 NO NO 22095
178D>E 32 NO NO 22096
179L>F/I 128 NO NO 22097
179L>R/P 9 NO NO 22098
180E>K/Q 21 NO NO 22100
180E>A/G/V 401 NO NO 22101
180E>D 23 NO NO 22102
181G>R 186 NO NO 22103
181G>X/A/V/E 888 NO NO 22104
182K>E 4 NO NO 22106
182K>R/T 70 NO NO 22107
182K>N 27 NO NO 22108
183Q>E 4 NO NO 22109
183Q>L/R/P 88 NO NO 22110
183Q>H 51 NO NO 22111
184G>S 69 NO NO 22112
184G>D/V/A 44 NO NO 22113
185N>Y/D 16 NO NO 22115
185N>S/I 162 NO NO 22116
185N>K 13 NO NO 22117
186F>V/L 5 NO NO 22118
186F>S/Y 44 NO NO 22119
186F>L 295 NO NO 22120
187K>R 2 NO NO 22122
187K>N 6 NO NO 22123
188N>D/H/Y 8 NO NO 22124
188N>T/I/S 20 NO NO 22125
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突变位点在蛋白结构上的标注

突变株数最高的三个位点已在图一中标出。为更清晰的展示其它突变位点,我们在spike蛋白A链三维结构各个角度截图展示。(ABC三个链序列相同,但在三级结构上看有些许差异)