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2019新型冠状病毒信息库

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2019新型冠状病毒信息库 (2019nCoVR)

S蛋白突变位点分析与结构展示

Spike蛋白结构(PDB_ID: 6VSB)

Spike为三聚体,如下图所示ABC三条相同链组成,分别为用蓝色,黄色,绿色显示。 此外,Spike蛋白与其受体人ACE2结合片段为residues: 336-516,3条链均有此片段,统一用青色显示。

SARS_COV_2的Spike序列突变分析

突变名称 病毒株数 在ACE2结合区域 是否关键互作氨基酸 基因组位置 查看结构图
2F>L 1 NO NO 21568
3V>G 2 NO NO 21570
4F>S 1 NO NO 21573
5L>I/F 353 NO NO 21575
6V>I/F 49 NO NO 21578
7L>V 2 NO NO 21581
8L>V 14 NO NO 21584
8L>W 4 NO NO 21585
8L>F 3 NO NO 21586
9P>T/S 7 NO NO 21587
9P>L 6 NO NO 21588
10L>I 12 NO NO 21590
11V>I/F 4 NO NO 21593
12S>F/C 13 NO NO 21597
13S>N/I 12 NO NO 21600
14Q>H 11 NO NO 21604
15C>F 7 NO NO 21606
16V>F 4 NO NO 21608
17N>Y 2 NO NO 21611
17N>K 1 NO NO 21613
18L>I/F 82 NO NO 21614
19T>S 1 NO NO 21617
19T>I 4 NO NO 21618
20T>S 1 NO NO 21620
20T>I 14 NO NO 21621
21R>K/I/T 173 NO NO 21624
22T>N/I 30 NO NO 21627
23Q>K/* 3 NO NO 21629
24L>I 4 NO NO 21632
24L>S 1 NO NO 21633
25P>S 6 NO NO 21635
25P>L 5 NO NO 21636
26P>S 24 NO NO 21638
26P>L/R 17 NO NO 21639
27A>T/S 11 NO NO 21641
27A>V 10 NO NO 21642
28Y>N/H 10 NO NO 21644
29T>A 1 NO NO 21647
29T>I 63 NO NO 21648
30N>T 1 NO NO 21651
32F>I/L 2 NO NO 21656
32F>Y 1 NO NO 21657
32F>L 20 NO NO 21658
33T>S 1 NO NO 21659
33T>I 3 NO NO 21660
34R>C 2 NO NO 21662
35G>V 1 NO NO 21666
38Y>C 1 NO NO 21675
45S>P 1 NO NO 21695
46S>A 3 NO NO 21698
46S>L 2 NO NO 21699
47V>I/F 3 NO NO 21701
49H>Y 80 NO NO 21707
50S>L 25 NO NO 21711
51T>I 2 NO NO 21714
52Q>L 14 NO NO 21717
52Q>H 13 NO NO 21718
54L>F 186 NO NO 21724
57P>S 1 NO NO 21731
62V>I/F/L 4 NO NO 21746
64W>R 1 NO NO 21752
64W>L 2 NO NO 21753
67A>S 9 NO NO 21761
67A>V 7 NO NO 21762
68I>R 1 NO NO 21765
69H>Y 8 NO NO 21767
69H>R 1 NO NO 21768
70V>F 7 NO NO 21770
71S>Y/F 11 NO NO 21774
72G>R/W 4 NO NO 21776
72G>E/V 3 NO NO 21777
73T>I 6 NO NO 21780
74N>K 11 NO NO 21784
75G>R 1 NO NO 21785
75G>D/V 24 NO NO 21786
76T>I 23 NO NO 21789
77K>M 14 NO NO 21792
77K>N 6 NO NO 21793
78R>K/M 15 NO NO 21795
78R>S 2 NO NO 21796
79F>I 1 NO NO 21797
79F>L 1 NO NO 21799
80D>N/Y 22 NO NO 21800
80D>A 4 NO NO 21801
83V>F 6 NO NO 21809
84L>I 5 NO NO 21812
86F>Y/S 2 NO NO 21819
87N>Y 1 NO NO 21821
88D>N/Y/H 4 NO NO 21824
88D>A 2 NO NO 21825
88D>E 4 NO NO 21826
90V>F/L 7 NO NO 21830
92F>L 1 NO NO 21836
93A>S 1 NO NO 21839
94S>F 2 NO NO 21843
95T>A 8 NO NO 21845
95T>N/I 44 NO NO 21846
96E>G 1 NO NO 21849
96E>D 5 NO NO 21850
97K>Q/E 2 NO NO 21851
97K>T 5 NO NO 21852
97K>N 2 NO NO 21853
98S>F 41 NO NO 21855
100I>T 7 NO NO 21861
101I>V 1 NO NO 21863
102R>G 1 NO NO 21866
102R>I 8 NO NO 21867
102R>S 3 NO NO 21868
103G>A 1 NO NO 21870
105I>L/V 5 NO NO 21875
107G>C 2 NO NO 21881
109T>S 1 NO NO 21888
111D>N 5 NO NO 21893
112S>P 2 NO NO 21896
113K>R 1 NO NO 21900
116S>C 1 NO NO 21909
118L>F 6 NO NO 21914
119I>V 11 NO NO 21917
120V>I/F 7 NO NO 21920
123A>V 3 NO NO 21930
125N>H 1 NO NO 21935
125N>S 1 NO NO 21936
127V>F 4 NO NO 21941
127V>A 1 NO NO 21942
128I>F 1 NO NO 21944
129K>N 2 NO NO 21949
130V>A 2 NO NO 21951
132E>D 2 NO NO 21958
136C>R/G 3 NO NO 21968
138D>Y/H 53 NO NO 21974
140F>L/V 5 NO NO 21980
141L>F 4 NO NO 21985
142G>S 3 NO NO 21986
142G>D/V/A 8 NO NO 21987
143V>F 5 NO NO 21989
144Y>H 1 NO NO 21992
144Y>F 1 NO NO 21993
145Y>N/H 13 NO NO 21995
146H>N/Y 18 NO NO 21998
146H>R 3 NO NO 21999
146H>Q 23 NO NO 22000
148N>Y/D 5 NO NO 22004
148N>S 4 NO NO 22005
148N>K 2 NO NO 22006
149N>H 1 NO NO 22007
150K>N 1 NO NO 22012
151S>G 1 NO NO 22013
151S>N/I 17 NO NO 22014
152W>R 3 NO NO 22016
152W>L 13 NO NO 22017
153M>V 3 NO NO 22019
153M>T 9 NO NO 22020
153M>I 27 NO NO 22021
154E>Q 1 NO NO 22022
154E>V 1 NO NO 22023
155S>I/T 6 NO NO 22026
156E>G 1 NO NO 22029
156E>D 3 NO NO 22030
157F>S 4 NO NO 22032
157F>L 4 NO NO 22033
158R>S 3 NO NO 22036
159V>I 2 NO NO 22037
161S>T 2 NO NO 22043
162S>I 1 NO NO 22047
163A>V 3 NO NO 22050
164N>S 1 NO NO 22053
171V>F 4 NO NO 22073
172S>F 1 NO NO 22077
173Q>H 4 NO NO 22081
176L>I/F 16 NO NO 22088
177M>K/T 2 NO NO 22092
177M>I 21 NO NO 22093
178D>N 4 NO NO 22094
179L>I/F 4 NO NO 22097
180E>K 2 NO NO 22100
180E>V/G 3 NO NO 22101
180E>D 3 NO NO 22102
181G>R 10 NO NO 22103
181G>V/A 15 NO NO 22104
182K>R 10 NO NO 22107
182K>N 3 NO NO 22108
183Q>L/R 2 NO NO 22110
183Q>H 1 NO NO 22111
185N>D 2 NO NO 22115
185N>S 3 NO NO 22116
185N>K 2 NO NO 22117
186F>S 4 NO NO 22119
188N>D 2 NO NO 22124
188N>I 1 NO NO 22125
188N>K 3 NO NO 22126
190R>K 3 NO NO 22131
193V>L 5 NO NO 22139
197I>V 16 NO NO 22151
197I>S 1 NO NO 22152
198D>G 4 NO NO 22155
202K>N 1 NO NO 22168
203I>T 2 NO NO 22170
203I>M 6 NO NO 22171
206K>R 1 NO NO 22179
211N>Y 4 NO NO 22193
212L>S 2 NO NO 22197
213V>L 18 NO NO 22199
213V>A 9 NO NO 22200
214R>H/L 21 NO NO 22203
215D>N/Y/H 39 NO NO 22205
215D>G 35 NO NO 22206
216L>F 20 NO NO 22208
218Q>K/E 2 NO NO 22214
218Q>L/R 2 NO NO 22215
219G>D 2 NO NO 22218
220F>I/L 12 NO NO 22220
221S>L/W 32 NO NO 22224
222A>S/P 3 NO NO 22226
222A>V 20 NO NO 22227
224E>Q 1 NO NO 22232
226L>V 2 NO NO 22238
228D>Y/H 4 NO NO 22244
229L>F 2 NO NO 22249
231I>L 4 NO NO 22253
231I>T 1 NO NO 22254
232G>C 1 NO NO 22256
233I>V 5 NO NO 22259
233I>S 1 NO NO 22260
239Q>K 11 NO NO 22277
239Q>R 2 NO NO 22278
240T>P 5 NO NO 22280
240T>I 11 NO NO 22281
242L>F 8 NO NO 22286
243A>S/P 7 NO NO 22289
243A>X/V 4 NO NO 22290
244L>F 2 NO NO 22294
245H>Y 18 NO NO 22295
245H>R 2 NO NO 22296
246R>K/I 3 NO NO 22299
246R>S 1 NO NO 22300
247S>N 1 NO NO 22302
247S>R 3 NO NO 22303
248Y>H 1 NO NO 22304
248Y>S/C 2 NO NO 22305
249L>S 3 NO NO 22308
249L>F 16 NO NO 22309
250T>N/I 5 NO NO 22311
251P>S 2 NO NO 22313
251P>L 1 NO NO 22314
252G>D 1 NO NO 22317
253D>Y 7 NO NO 22319
253D>G 12 NO NO 22320
254S>F 19 NO NO 22323
255S>P 4 NO NO 22325
255S>F 15 NO NO 22326
256S>P 1 NO NO 22328
256S>L 6 NO NO 22329
257G>S 4 NO NO 22331
257G>D 7 NO NO 22332
258W>L 18 NO NO 22335
260A>S 3 NO NO 22340
260A>V 2 NO NO 22341
261G>S/C/R 10 NO NO 22343
261G>D/V 10 NO NO 22344
262A>T/S 23 NO NO 22346
263A>T/S 5 NO NO 22349
263A>V 5 NO NO 22350
264A>S 2 NO NO 22352
265Y>N 1 NO NO 22355
265Y>C 1 NO NO 22356
266Y>C 1 NO NO 22359
267V>L 4 NO NO 22361
271Q>R 3 NO NO 22374
272P>S 1 NO NO 22376
273R>K 2 NO NO 22380
273R>S 23 NO NO 22381
276L>I 20 NO NO 22388
276L>P 3 NO NO 22389
281E>Q 7 NO NO 22403
281E>V 6 NO NO 22404
286T>I 2 NO NO 22419
288A>T/S 4 NO NO 22424
289V>I/L 14 NO NO 22427
290D>E 14 NO NO 22432
292A>S 6 NO NO 22436
296L>H 3 NO NO 22449
297S>T 2 NO NO 22451
297S>L 3 NO NO 22452
298E>G 1 NO NO 22455
299T>I 8 NO NO 22458
301C>F 2 NO NO 22464
302T>A 2 NO NO 22466
303L>F 4 NO NO 22471
304K>R 1 NO NO 22473
307T>S/A 5 NO NO 22481
307T>N/I 25 NO NO 22482
308V>I/L 21 NO NO 22484
309E>Q 9 NO NO 22487
309E>A 4 NO NO 22488
311G>E 1 NO NO 22494
314Q>K 1 NO NO 22502
314Q>L/R 3 NO NO 22503
315T>I 3 NO NO 22506
317N>D 1 NO NO 22511
318F>L 4 NO NO 22514
320V>F 1 NO NO 22520
320V>G 123 NO NO 22521
321Q>L 2 NO NO 22524
323T>S 1 NO NO 22529
323T>I 19 NO NO 22530
325S>F/SX 3 NO NO 22536
327V>F 1 NO NO 22541
330P>S 16 YES NO 22550
330P>L 1 YES NO 22551
336C>R 1 YES NO 22568
337P>S 2 YES NO 22571
338F>L 2 YES NO 22574
339G>D 2 YES NO 22578
340E>K 2 YES NO 22580
341V>I 24 YES NO 22583
342F>C 1 YES NO 22587
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345T>S 1 YES NO 22595
346R>K 2 YES NO 22599
348A>T/S 6 YES NO 22604
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1262E>D 5 NO NO 25348
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1264V>L 9 NO NO 25352
1265L>F 2 NO NO 25355
1265L>P 2 NO NO 25356
1273T>I 3 NO NO 25380

突变位点在蛋白结构上的标注

突变株数最高的三个位点已在图一中标出。为更清晰的展示其它突变位点,我们在spike蛋白A链三维结构各个角度截图展示。(ABC三个链序列相同,但在三级结构上看有些许差异)