National Genomics Data Center

Changpeng Xin

Team Leader,

Email: xinchangpeng (AT) picb.ac.cn

Tel:


个人信息 

出生日期:1983/01/13                        

联系电话:15601981793/13761534049  

电子邮箱:changpeng.xin@gmail.com

联系地址:上海市徐汇区岳阳路320号生理楼126200031

教育背景

上海生科院计算生物学研究所

计算生物学

博士

2010/09-2014/09

Ø    光呼吸支路代谢途径建模分析

Ø    转光呼吸支路代谢途径拟南芥的转录组分析

Ø    自主设计制作多款仪器设备

厦门大学生命科学学院 

植物生态学

硕士

2005/09-2008/06

Ø    红树植物沿河分布格局及对咸淡水交替环境的适应机制研究

Ø    自主设计制作了一套模拟河流入海口处水体盐度日变化的实验装置

山东农业大学生命科学学院

生物技术

本科

2001/09-2005/06

Ø    多次荣获一等专业奖学金、组织管理单项奖等荣誉

Ø    自学多种计算机语言,协助维护校园网系统、参与开发维护学校校友录网站

工作经历

上海生科院计算生物学研究所

平台主任

2015/12-至今

Ø    单细胞测序技术开发

Ø    NanoPore测序技术开发

Ø    面向科研人员提供生物信息分析技术支持

Ø    多维组学数据平台的日常运行管理

Ø    积极参与大数据中心建设

上海植物园

工程师

2014/10-2015/11

Ø    C4植物种质资源搜集与引种

Ø    组织建设室内恒温恒湿培养温室

Ø    设计制作高亮度LED冷光源

上海生科院计算生物学研究所 

助理研究员

2009/01-2010/09

Ø    叶绿素荧光动力学的数学建模分析

Ø    协助管理实验室仪器设备并为同事及学生提供仪器设备的技术支持

上海泽泉科技有限公司

技术工程师

2008/07-2008/12

Ø 为客户提供仪器安装服务及技术支持

Ø 为销售人员提供培训及技术支持

Ø 翻译制作仪器说明书及技术手册

 技能

Ø  擅长C语言、PythonRVBMatlab计算机编程及数学建模

Ø  熟悉分子生物学的基本操作

Ø  熟练使用Linux系统(9年使用经验);熟悉Linux服务器搭建与维护

Ø  精通多种仪器设备的使用,对各种仪器设备可快速上手

Ø  擅长运用AutoCAD、单片机及PLC进行仪器开发,曾自主设计制作多种仪器

Ø  可将英语作为主要工作语言,可熟练使用英语进行听说读写

发表论文及专利

JHuang Xue, GD Chen, FH Hao, H Chen, ZY Fang, FF Chen, B Pang, QL Yang, XB Wei, QQ Fan, CP Xin, JH Zhao, X Deng, BA Wang, XJ Zhang, YY Chu, H Tang, HY Yin, WM Ma, LN Chen, JP Ding, E Weinhold, R M Kohli, W Liu, ZJ Zhu, KY Huang, HR Tang, GL Xu. 2019 A vitamin-C-derived DNA modification catalysed by an algal TET homologue. Nature 569:581-585

YW Ma, L Yu, X Zhang, CP Xin, SS Huang, L Bai, W Chen, R Gao, J Li, S Pan, XL Qi, XX Huang & LF Zhang. 2018 Highly efficient and precise base editing by engineered dCas9-guide tRNA adenosine deaminase in rats. Cell Discovery 4:39

S Bai, KQ Fu, HQ Yin, YQ Cui, QL Yue, WB Li, L Cheng, HH Tan, XF Liu, YS Guo, YW Zhang, J Xie, WX He, YY Wang, H Feng, CP Xin, JW Zhang, MY Lin, B Shen, Z Sun, XJ Guo, K Zheng, L Ye. 2018 Sox30 initiates transcription of haploid genes during late meiosis and spermiogenesis in mouse testes. Development 145, DEV 164855

Y Xiao, TG Chang, QF Song, SY Wang, D Tholen, Y Wang, CP Xin, GY Zheng, HL Zhao, XG Zhu. 2017. ePlant for quantitative and predictive plant science research in the big data era—Lay the foundation for the future model guided crop breeding, engineering and agronomy. Quantitative Biology 5:260-271

TG Chang, CP Xin, MN Qu, HL Zhao, QF Song, XG Zhu. 2017. Evaluation of Protocols for Measuring Leaf Photosynthetic Properties of Field-Grown Rice. Rice Science 24:1-9

X Wang, W Liu, CP Xin, Y Zheng, YB Cheng, S Sun, RZ Li, XG Zhu, S. Y. Dai, P. M. Rentzepis, and J. S. Yuan. 2016 Enhanced limonene production in cyanobacteria reveals photosynthesis limitations. PNAs 113:14225-14230.

TG Chang, CP Xin, MN Qu, HL Zhao, QF Song, XG Zhu. 2016 Evaluation of protocols for measuring field-grown rice leaf photosynthetic properties. Rice Science 24:1-9

CP Xin, D Tholen, V Devloo, XG Zhu. 2015 The benefits of photorespiratory bypasses: How can they work? Plant Physiology 167: 574-585.

CP Xin, J Yang, XG Zhu. 2013 A model of chlorophyll a fluorescence induction kinetics with explicit description of structural constraints of individual photosystem II units. Photosynthesis Research 117:339-54.

L Liu, FZ Shen, CP Xin, Z Wang. 2015 Multi-scale modeling of Arabidopsis thaliana response to different CO2 conditions: from gene expression to metabolic flux. Journal of Integrative Plant Biology doi: 10.1111/jipb.12370.

S Hamdani, MN Qu, CP Xin, M Li, CC ChuGovindjeeXG Zhu. 2015 Variations between the photosynthetic properties of elite and landrace Chinese rice cultivars revealed by simultaneous measurements of 820 nm transmission signal and chlorophyll a fluorescence induction. Journal of Plant Physiology 177:128-138.

CY Jiang, D Tholen, JJ Xu, CP Xin, H Zhang, XG Zhu, YX Zhao. 2014 Increased expression of mitochondria-localized carbonic anhydrase activity resulted in an increased biomass accumulation in Arabidopsis thaliana. Journal of Plant Biology 57:366-374.

XG Zhu, GL Zhang, D Tholen, Y Wang, CP Xin, QF Song. 2011 The next generation models for crops and agro-ecosystems. Science China Information Sciences 54: 589-597.

郭峰,曲妍妍,信长朋,梁燕,梁雪,田纪春,孟庆伟。 2009 弱光下生长的高产小麦品系PH01-35旗叶光合机构对不同光强的响应。作物学报 35:179-184.

郭健鸣,宋青峰,信长朋,朱新广。2015 实用新型专利“一种植物表型扫描装置”。(CN201520299589.X