Editing Factor: | MEF11 |
Synonym: | LOI1, LOVASTATIN INSENSITIVE 1, MEF11, MITOCHONDRIAL RNA EDITING FACTOR 11 |
Description: | Encodes a pentatricopeptide (PPR) protein that binds single-stranded RNA, the N-terminal portion of the protein can localize to the mitochondria. Mutations in this gene make plants less sensitive to inhibitors of the MEP and MVA pathways of isoprenoid biosynthesis and increase the activity of HMG CoA reductase. |
Protein Family: | PPR |
Subclass: | DYW |
Construct Structure: | PLS-E-DYW, PLS-E like-DYW |
Gene ID & Species: | AT4G14850 (Arabidopsis thaliana) |
Edited Gene(s): | nad4 ccmFN2 cox3 matR ccmC ccmFc |
Editing Type(s): | C-to-U (70) |
Publication(s): |
[1] The Analysis of the Editing Defects in the dyw2 Mutant Provides New Clues for the Prediction of RNA Targets of Arabidopsis E+-Class PPR Proteins, Plants (Basel), 2020. [PMID=32098170] [2] Multiple PPR Protein Interactions Are Involved in the RNA Editing System in Arabidopsis Mitochondria and Plastids, Proc Natl Acad Sci U S A, 2017. [PMID=28761003] [3] The ABA-Deficiency Suppressor Locus HAS2 Encodes the PPR Protein LOI1/MEF11 Involved in Mitochondrial RNA Editing, Molecular Plant, 2015. [PMID=25708384] [4] Improved computational target site prediction for pentatricopeptide repeat RNA editing factors, PLoS One, 2013. [PMID=23762347] [5] A truncated MEF11 protein shows site-specific effects on mitochondrial RNA editing, Plant Signaling & Behavior, 2010. [PMID=20436293] [6] The mitochondrial PPR protein LOVASTATIN INSENSITIVE 1 plays regulatory roles in cytosolic and plastidial isoprenoid biosynthesis through RNA editing, The Plant Journal, 2010. [PMID=19929879] [7] The PPR protein encoded by the LOVASTATIN INSENSITIVE 1 gene is involved in RNA editing at three sites in mitochondria of Arabidopsis thaliana, The Plant Journal, 2010. [PMID=19919573] |
Species | Gene ID | Organelle | Edited Gene | Position | Region | Editing Type | Codon | Amino Acid | Molecular Effect | Experiment Details | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | ccmC | 568 | CDS | C-to-U | NA=>NA | NA=>NA | NA |
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | ccmFc | 378 | CDS | C-to-U | NA=>NA | NA=>NA | Synonymous |
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | ccmFN2 | 344 | CDS | C-to-U | CCA=>CUA NA=>NA |
P=>L NA=>NA |
Recoding NA |
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | cox3 | 422 | CDS | C-to-U | CCU=>CUU NA=>NA |
P=>L NA=>NA |
Recoding NA |
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | matR | 1730 | CDS | C-to-U | NA=>NA | NA=>NA | NA |
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Arabidopsis thaliana | AT4G14850 | Mitochondrion | nad4 | 124 | CDS | C-to-U | CUG=>UUG NA=>NA |
L=>L NA=>NA |
Synonymous NA |
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