Identifier PRJCA000230
Title Whole transcriptome sequencing in 274 glioma patients reveals gene fusion profiling and novel candidate fusion genes
Project data type Transcriptome or Gene expression
Organism Homo sapiens
Description We detected fusion genes in 274 fresh surgical samples of gliomas using whole transcriptome sequencing. Using this approach we screened a panel of glioma samples and identified a number of activating novel fusion transcripts.
Sample scope Monoisolate
Release date 2016-05-05
Publication
PubMed ID Title Journal Doi Year
25135958 RNA-seq of 272 gliomas revealed a novel, recurrent PTPRZ1-MET fusion transcript in secondary glioblastomas. Genome research 10.1101/gr.165126.113 2015
Submitter Yadong  Yang  (yangyd@big.ac.cn)
Affiliation Beijing Institute of Genomics
Submission date 2016-05-05

Project Data

Resource name Description
BioSample (274) -
SAMC006218 SRR934990
SAMC006217 SRR934989
SAMC006216 SRR934988
SAMC006215 SRR934987
SAMC006214 SRR934986
SAMC006213 SRR934985
SAMC006212 SRR934984
SAMC006211 SRR934983
SAMC006210 SRR934982
SAMC006209 SRR934981
SAMC006208 SRR934980
SAMC006207 SRR934979
SAMC006206 SRR934978
SAMC006205 SRR934977
SAMC006204 SRR934976
SAMC006203 SRR934975
SAMC006202 SRR934974
SAMC006201 SRR934973
SAMC006200 SRR934972
SAMC006199 SRR934971
SAMC006198 SRR934970
SAMC006197 SRR934969
SAMC006196 SRR934968
SAMC006195 SRR934967
SAMC006194 SRR934966
SAMC006193 SRR934965
SAMC006192 SRR934964
SAMC006191 SRR934963
SAMC006190 SRR934962
SAMC006189 SRR934961
SAMC006188 SRR934960
SAMC006187 SRR934959
SAMC006186 SRR934958
SAMC006185 SRR934957
SAMC006184 SRR934956
SAMC006183 SRR934955
SAMC006182 SRR934954
SAMC006181 SRR934953
SAMC006180 SRR934952
SAMC006179 SRR934951
SAMC006178 SRR934950
SAMC006177 SRR934949
SAMC006176 SRR934948
SAMC006175 SRR934947
SAMC006174 SRR934946
SAMC006173 SRR934945
SAMC006172 SRR934944
SAMC006171 SRR934943
SAMC006170 SRR934942
SAMC006169 SRR934941
SAMC006168 SRR934940
SAMC006167 SRR934939
SAMC006166 SRR934938
SAMC006165 SRR934937
SAMC006164 SRR934936
SAMC006163 SRR934935
SAMC006162 SRR934934
SAMC006161 SRR934933
SAMC006160 SRR934932
SAMC006159 SRR934931
SAMC006158 SRR934930
SAMC006157 SRR934929
SAMC006156 SRR934928
SAMC006155 SRR934927
SAMC006154 SRR934926
SAMC006153 SRR934925
SAMC006152 SRR934924
SAMC006151 SRR934923
SAMC006150 SRR934922
SAMC006149 SRR934921
SAMC006148 SRR934920
SAMC006147 SRR934919
SAMC006146 SRR934918
SAMC006145 SRR934917
SAMC006144 SRR934916
SAMC006143 SRR934915
SAMC006142 SRR934914
SAMC006141 SRR934913
SAMC006140 SRR934912
SAMC006139 SRR934911
SAMC006138 SRR934910
SAMC006137 SRR934909
SAMC006136 SRR934908
SAMC006135 SRR934907
SAMC006134 SRR934906
SAMC006133 SRR934905
SAMC006132 SRR934904
SAMC006131 SRR934903
SAMC006130 SRR934902
SAMC006129 SRR934901
SAMC006128 SRR934900
SAMC006127 SRR934899
SAMC006126 SRR934898
SAMC006125 SRR934897
SAMC006124 SRR934896
SAMC006123 SRR934895
SAMC006122 SRR934894
SAMC006121 SRR934893
SAMC006120 SRR934892
SAMC006119 SRR934891
SAMC006118 SRR934890
SAMC006117 SRR934889
SAMC006116 SRR934888
SAMC006115 SRR934887
SAMC006114 SRR934886
SAMC006113 SRR934885
SAMC006112 SRR934884
SAMC006111 SRR934883
SAMC006110 SRR934882
SAMC006109 SRR934881
SAMC006108 SRR934880
SAMC006107 SRR934879
SAMC006106 SRR934878
SAMC006105 SRR934877
SAMC006104 SRR934876
SAMC006103 SRR934875
SAMC006102 SRR934874
SAMC006101 SRR934873
SAMC006100 SRR934872
SAMC006099 SRR934871
SAMC006098 SRR934870
SAMC006097 SRR934869
SAMC006096 SRR934868
SAMC006095 SRR934867
SAMC006094 SRR934866
SAMC006093 SRR934865
SAMC006092 SRR934864
SAMC006091 SRR934863
SAMC006090 SRR934862
SAMC006089 SRR934861
SAMC006088 SRR934860
SAMC006087 SRR934859
SAMC006086 SRR934858
SAMC006085 SRR934857
SAMC006084 SRR934856
SAMC006083 SRR934855
SAMC006082 SRR934854
SAMC006081 SRR934853
SAMC006080 SRR934852
SAMC006079 SRR934851
SAMC006078 SRR934850
SAMC006077 SRR934849
SAMC006076 SRR934848
SAMC006075 SRR934847
SAMC006074 SRR934846
SAMC006073 SRR934845
SAMC006072 SRR934844
SAMC006071 SRR934843
SAMC006070 SRR934842
SAMC006069 SRR934841
SAMC006068 SRR934840
SAMC006067 SRR934839
SAMC006066 SRR934838
SAMC006065 SRR934837
SAMC006064 SRR934836
SAMC006063 SRR934835
SAMC006062 SRR934834
SAMC006061 SRR934833
SAMC006060 SRR934832
SAMC006059 SRR934831
SAMC006058 SRR934830
SAMC006057 SRR934829
SAMC006056 SRR934828
SAMC006055 SRR934827
SAMC006054 SRR934826
SAMC006053 SRR934825
SAMC006052 SRR934824
SAMC006051 SRR934823
SAMC006050 SRR934822
SAMC006049 SRR934821
SAMC006048 SRR934820
SAMC006047 SRR934819
SAMC006046 SRR934818
SAMC006045 SRR934817
SAMC006044 SRR934816
SAMC006043 SRR934815
SAMC006042 SRR934814
SAMC006041 SRR934813
SAMC006040 SRR934812
SAMC006039 SRR934811
SAMC006038 SRR934810
SAMC006037 SRR934809
SAMC006036 SRR934808
SAMC006035 SRR934807
SAMC006034 SRR934806
SAMC006033 SRR934805
SAMC006032 SRR934804
SAMC006031 SRR934803
SAMC006030 SRR934802
SAMC006029 SRR934801
SAMC006028 SRR934800
SAMC006027 SRR934799
SAMC006026 SRR934798
SAMC006025 SRR934797
SAMC006024 SRR934796
SAMC006023 SRR934795
SAMC006022 SRR934794
SAMC006021 SRR934793
SAMC006020 SRR934792
SAMC006019 SRR934791
SAMC006018 SRR934790
SAMC006017 SRR934789
SAMC006016 SRR934788
SAMC006015 SRR934787
SAMC006014 SRR934786
SAMC006013 SRR934785
SAMC006012 SRR934784
SAMC006011 SRR934783
SAMC006010 SRR934782
SAMC006009 SRR934781
SAMC006008 SRR934780
SAMC006007 SRR934779
SAMC006006 SRR934778
SAMC006005 SRR934777
SAMC006004 SRR934776
SAMC006003 SRR934775
SAMC006002 SRR934774
SAMC006001 SRR934773
SAMC006000 SRR934772
SAMC005999 SRR934771
SAMC005998 SRR934770
SAMC005997 SRR934769
SAMC005996 SRR934768
SAMC005995 SRR934767
SAMC005994 SRR934766
SAMC005993 SRR934765
SAMC005992 SRR934764
SAMC005991 SRR934763
SAMC005990 SRR934762
SAMC005989 SRR934761
SAMC005988 SRR934760
SAMC005987 SRR934759
SAMC005986 SRR934758
SAMC005985 SRR934757
SAMC005984 SRR934756
SAMC005983 SRR934755
SAMC005982 SRR934754
SAMC005981 SRR934753
SAMC005980 SRR934752
SAMC005979 SRR934751
SAMC005978 SRR934750
SAMC005977 SRR934749
SAMC005976 SRR934748
SAMC005975 SRR934747
SAMC005974 SRR934746
SAMC005973 SRR934745
SAMC005972 SRR934744
SAMC005971 SRR934743
SAMC005970 SRR934742
SAMC005969 SRR934741
SAMC005968 SRR934740
SAMC005967 SRR934739
SAMC005966 SRR934738
SAMC005965 SRR934737
SAMC005964 SRR934736
SAMC005963 SRR934735
SAMC005962 SRR934734
SAMC005961 SRR934733
SAMC005960 SRR934732
SAMC005959 SRR934731
SAMC005958 SRR934730
SAMC005957 SRR934729
SAMC005956 SRR934728
SAMC005955 SRR934727
SAMC005954 SRR934726
SAMC005953 SRR934725
SAMC005952 SRR934724
SAMC005951 SRR934723
SAMC005950 SRR934722
SAMC005949 SRR934721
SAMC005948 SRR934720
SAMC005947 SRR934719
SAMC005946 SRR934718
SAMC005945 SRR934717
GSA (1) -
CRA000100 CRA000100